Dans les fichiers de sortie SLURM, les lignes peuvent correspondre à des taches MPI différentes. Il est intéressant (dans le cas d’un débogage, de labelliser avec le rang MPI chaque ligne du listing.
Pour arriver à cela, il suffit d’ajouter une option à la commande de lancement de son programme parallèle.
Pour IntelMPI
Il faut utiliser l’option -prepend rank sur la ligne de commande.
- Exemple :
mpirun -prepend-rank -n $SLURM_NTASKS ./intelmpi_tandt1
- Listing de sortie :
[0] filling array on rank 0 [1] filling array on rank 1 [2] filling array on rank 2 [3] filling array on rank 3 [3] forrtl: severe (408): fort: (2): Subscript #1 of the array VECTOR has value 4 which is greater than the upper bound of 3 [3] [3] Image PC Routine Line Source [3] intelmpi_tandt1 0000000000405DD6 Unknown Unknown Unknown [3] intelmpi_tandt1 0000000000403E43 MAIN__ 21 tandt1.f90 [3] intelmpi_tandt1 000000000040375E Unknown Unknown Unknown [3] libc.so.6 00007FBE1813FD5D Unknown Unknown Unknown [3] intelmpi_tandt1 0000000000403669 Unknown Unknown Unknown
On voit clairement que c’est le rang numéro 3 qui pose problème (le « [3] » en début de ligne)
Pour la version BullXMPI
C’est l’option –label qu’il faut utiliser sur sa ligne de commande.
- Exemple :
srun --label --mpi=pmi2 -K1 --resv-ports -n $SLURM_NTASKS ./bullxmpi_tandt1
- Listing de sortie :
0: filling array on rank 0 2: filling array on rank 2 3: filling array on rank 3 1: filling array on rank 1 3: forrtl: severe (408): fort: (2): Subscript #1 of the array VECTOR has value 4 which is greater than the upper bound of 3 3: 3: Image PC Routine Line Source 3: bullxmpi_tandt1 000000000040AA16 Unknown Unknown Unknown 3: bullxmpi_tandt1 0000000000408A83 MAIN__ 21 tandt1.f90 3: bullxmpi_tandt1 000000000040839E Unknown Unknown Unknown 3: libc.so.6 00007F6258312D5D Unknown Unknown Unknown 3: bullxmpi_tandt1 00000000004082A9 Unknown Unknown Unknown
Ici aussi on voit le numéro du rang en début de ligne (« 3: » ).
